Горы Памира занимают восточную часть Памирской горной системы, где выделяется два региона: Западный Памир и Восточный Памир. Граница, проходящая между этими регионами, соединяет горную цепь Зулумарт с Усойским завалом и озером Яшилкуль.

Короткий и меридионально расположенный хребет Академии Наук считается главным состовляющим системы Памирских гор, средняя высота которого - 5757 м.