Через несколько дней после начала войны президиум Таджикского филиала АН СССР принял решение о переводе своих исследований на военную тематику. Так война способствовала бурному развитию геологических исследований по поиску необходимых военной промышленности руд цветных и редкоземельных металлов, минералов. Правда, доставка их часто осуществлялась гужевым транспортом, т.е. вьюками на ишаках по головокружительным тропам. Так, в частности, из Фанских гор доставляли для обогащения руду для получения сурьмы и мышьяка.
Начало войны заставило Таджикистан заняться и разработкой собственных угольных шахт. Уже к концу 1941 года таджикские геологи открыли и передали к использованию богатые месторождения горючего сланца в Фархарском и Кунгуртутском районах.